肽命名和分类指南
氨基酸的符号和结构
常见氨基酸(也称“蛋白质氨基酸”或“编码氨基酸”)以三个字母的符号表示,有时也以一个字母的符号表示。非常见氨基酸也以三个字母的符号表示,有时以一个字母“X”表示。下表列出了我们的网站和文献中使用的符号和缩写。
表 1. 常见氨基酸
颜色含义 - 酸性 碱性 非极性(疏水) 极性(不带电)
氨基酸 | 三字母符号 | 单字母符号 | 化学结构 |
---|---|---|---|
丙氨酸 | Ala | A | |
精氨酸 | Arg | R | |
天冬酰胺 | Asn | N | |
天冬氨酸 | Asp | D | |
半胱氨酸 | Cys | C | |
谷氨酰胺 | Gln | Q | |
谷氨酸 | Glu | E | |
甘氨酸 | Gly | G | |
组氨酸 | His | H | |
异亮氨酸 | Ile | I | |
亮氨酸 | Leu | L | |
赖氨酸 | Lys | K | |
甲硫氨酸 | Met | M | |
苯丙氨酸 | Phe | F | |
脯氨酸 | Pro | P | |
丝氨酸 | Ser | S | |
苏氨酸 | Thr | T | |
色氨酸 | Trp | W | |
酪氨酸 | Tyr | Y | |
缬氨酸 | Val | V |
表 2. 非常见氨基酸
三字母符号 | 氨基酸 |
---|---|
Aad | 2-氨基己二酸 |
Aan | α-天冬酰胺 |
Abu | 2-氨基丁酸 |
Aca | 2-氨基癸酸 |
Agn | α-谷氨酰胺 |
Aib | α-氨基异丁酸 |
Apm | 2-氨基庚二酸 |
App | γ-氨基-β-羟基苯戊酸 |
Asu | 2-氨基辛二酸 |
Aze | 2-羧酸酰胺 |
Bal | β-丙氨酸 |
Bas | β-天冬氨酸 |
Bly | 3,6-二氨基己酸(β-赖氨酸) |
Bua | 丁酸 |
Bux | 4-氨基-3-羟基丁酸 |
Cap | γ-氨基-β-羟基环己戊酸 |
Cha | 3-环己基丙氨酸 |
Cit | N5-氨基羰基鸟氨酸 |
Cya | 3-磺基丙氨酸 |
Dab | 2,4-二氨基丁酸 |
Dap | 二氨基丙酸 |
Dpm | 二氨基庚二酸 |
Dpr | 2,3-二氨基丙酸 |
Dsu | 2,7-二氨基辛二酸 |
Edc | S-乙基硫代半胱氨酸 |
Ggu | γ-谷氨酸 |
Gla | γ-羰基谷氨酸 |
Glc | 乙醇酸 |
Glp | 焦谷氨酸 (Pyr) (pGlu) |
Har | 高精氨酸 |
Hcy | 高半胱氨酸 |
Hhs | 高组氨酸 |
Hiv | 2-羟基异戊酸 |
Hse | 高丝氨酸 |
Hva | 2-羟基戊酸 |
Hyl | 5-羟基赖氨酸 |
Hyp | 4-羟基脯氨酸 |
Igl | α-氨基-2-茚乙酸 |
Iva | 异缬氨酸 |
Lac | 2-羟基丙酸(乳酸) |
Maa | 巯基乙酸 |
Mba | 巯基丁酸 |
Mhp | 3-羟基-4-甲基脯氨酸 |
Mpa | 巯基丙酸 |
Nal | 3-萘基丙氨酸 |
Nle | 正亮氨酸 |
Nphe | N-苄基甘氨酸 |
Nty | 正酪氨酸 |
Nva | 正缬氨酸 |
Oaa | ω-氨基酸 |
Oic | 八氢吲哚-2-羧酸 |
Orn | 鸟氨酸 |
Pen | 青霉胺(3-巯基缬氨酸) |
Phg | 2-苯甘氨酸 |
Pip | 哌啶-2-羧酸 |
pSer | 磷酸-L-丝氨酸 |
pThr | 磷酸-L-苏氨酸 |
pTyr | 磷酸-L-酪氨酸 |
Sar | 肌氨酸(N-甲基甘氨酸) |
Spg | 1-氨基-1-环戊酸 |
Sta | 他汀(4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸) |
Thi | 3-噻吩丙氨酸 |
Tic | 异喹啉-3-羧酸 |
Tle | 3-甲基缬氨酸 |
Tml | ε-N-三甲基赖氨酸 |
Tza | 3-噻唑丙氨酸 |
Und | 未定义 |
Wil | α-氨基-2,4-二氧嘧啶丙酸 |
表 3. 取代基
缩写 | 取代基 |
---|---|
Ac | 乙酰基 |
Bn | 苄基 (Bzl) |
Bz | 苯甲酰基 |
For | 甲酰基 |
Me | 甲基 |
Myr | 十四酰基 |
Z | 苄氧羰基 |